Quanto custa abrir CNPJ para médico em 2026?

• Abrir um CNPJ médico em 2026 custa a partir de R$1.600 em média, entre taxas públicas, certificado digital e honorários contábeis. Muitas contabilidades online oferecem abertura gratuita.
• Médicos não podem ser MEI: a empresa precisa ser constituída como SLU, LTDA ou Sociedade Simples, e a contabilidade é essencial desde a abertura.
• A inscrição da pessoa jurídica no CRM varia de estado para estado, podendo custar aproximadamente R$1.200 e a anuidade é calculada sobre o capital social declarado no contrato, tornando a definição desse valor uma decisão com impacto financeiro direto.
• Empresas que cumprem os critérios do conselho podem ter desconto de 80% na inscrição da pessoa jurídica no CRM em alguns estados, mas o requerimento precisa ser feito antes do registro
• Uma contabilidade online especializada orienta sobre o capital social adequado e conduz todo o processo de abertura de forma digital, com atendimento humanizado de contadores especializados na área.

Abrir um CNPJ para médico custa, em 2026, a partir de aproximadamente R$1.600 em taxas públicas. Esse valor soma o registro da empresa na Junta Comercial, a taxa de inscrição da pessoa jurídica no CRM e o certificado digital. Como médico não pode ser MEI, a empresa precisa ser constituída como SLU ou LTDA, e o custo total varia conforme o estado, a licença da vigilância sanitária e os honorários contábeis, que em muitos planos de contabilidade online não são cobrados na abertura.

Para o médico, o custo de abrir um CNPJ não depende apenas das taxas públicas, mas também das decisões tomadas antes do registro: o capital social declarado no contrato define a faixa da anuidade que a empresa vai pagar ao CRM todos os anos. Já o CNAE e o endereço da empresa define o grau de risco na vigilância sanitária. 

Além disso, a simulação do melhor regime tributário, incluindo o entendimento prévio do Fator R, ajuda o profissional médico a definir em conjunto com a sua contabilidade qual é o melhor regime tributário, como por exemplo o Simples Nacional. 

Uma contabilidade online cruza essas variáveis antes do protocolo na REDESIM, simula o impacto tributário e o enquadramento de cada cenário e conduz a abertura de forma digital, com atendimento de contadores especializados na área de saúde.

Neste artigo, detalhamos cada custo envolvido na abertura de um CNPJ para médico em 2026, do registro na Junta Comercial à anuidade do CRM, e explicamos como cada decisão tomada antes do protocolo afeta o que a empresa vai pagar nos meses e anos seguintes.

Quanto custa abrir CNPJ para médico?

Abrir um CNPJ médico envolve custos que se dividem em taxas públicas, definidas por órgãos governamentais e conselhos de classe, e custos variáveis, como os honorários contábeis. Serviços contábeis online costumam oferecer abertura sem custo.

O item que diferencia o médico de outros prestadores de serviço é a taxa de inscrição da pessoa jurídica no CRM, de aproximadamente R$ 1.200, exigida de toda empresa médica e o valor varia de estado para estado (no Parará, por exemplo, essa taxa é de R$950,00 reais). 

Como o médico não pode ser MEI, a contabilidade se torna essencial desde a abertura, e a escolha entre um modelo online e um tradicional impacta diretamente o custo total: na maioria das contabilidades online, os honorários de abertura não são cobrados.

Confira na tabela abaixo os principais custos envolvidos na abertura de um CNPJ médico.

Custo	Tipo	Valor de referência (2026)
Registro na Junta Comercial (ou cartório, se sociedade simples)	Taxa pública	De aproximadamente R$ 110 a R$ 420, conforme o estado (SP: aproximadamente R$ 219 para ME/EPP)
Inscrição da pessoa jurídica no CRM	Taxa pública (exclusiva de médicos)	Aproximadamente R$ 1.200, varia conforme o estado (PR: aproximadamente R$950,00)
Licença da vigilância sanitária / alvará	Taxa pública	Varia por município e atividade
Certificado digital (e-CNPJ A1)	Custo de abertura	De aproximadamente R$ 149 a R$ 235 (R$ 0 em alguns planos de contabilidade online)
Honorários de abertura	Custo variável	Sem custo na maioria das contabilidades online; de R$ 500 a R$ 3.000 na contabilidade tradicional

Médico pode ser MEI?

Não. Medicina é uma profissão regulamentada e a atividade médica não consta na lista de ocupações permitidas ao MEI, conforme o Portal do Empreendedor. O MEI foi criado para formalizar trabalhadores autônomos de atividades não regulamentadas por conselho de classe, como pedreiros, cabeleireiros e eletricistas. Profissões que exigem registro em conselho profissional, como medicina, advocacia e engenharia, estão fora do enquadramento.

Para abrir um CNPJ, o médico precisa constituir uma empresa. As opções mais comuns são a SLU (Sociedade Limitada Unipessoal) indicada para quem vai atuar sozinho e oferece responsabilidade limitada ao capital social declarado, e a LTDA (Sociedade Limitada), para dois ou mais sócios. 

Empresas médicas também podem ser constituídas como sociedade simples, uma natureza jurídica voltada para atividades intelectuais e profissões regulamentadas, cujo registro é feito em Cartório de Registro Civil de Pessoas Jurídicas, e não na Junta Comercial.

Como o MEI não é uma opção, toda empresa médica precisa de uma contabilidade desde a abertura, seja online ou tradicional. Na prática, isso significa que a escolha da contabilidade faz parte do processo de abertura. Uma contabilidade online conduz a abertura do CNPJ médico de forma 100% digital, com atendimento humanizado de contadores especializados na área de saúde, e em muitos casos sem cobrança de honorários de abertura.

Quais são os custos para abrir uma empresa médica?

Os custos de abertura de uma empresa médica se dividem em cinco categorias: honorários de abertura, registro na Junta Comercial ou cartório, inscrição no CRM, inscrição na Prefeitura e licença da vigilância sanitária e certificado digital. Cada um tem origem e lógica diferentes, mas todos incidem antes ou logo depois da emissão do CNPJ.

Honorários de abertura: contabilidade online ou tradicional

É o único custo da abertura que o médico consegue zerar. Em escritórios de contabilidade tradicional, os honorários de abertura variam de R$500 a R$3.000, cobrados separadamente da mensalidade. Em muitos planos de contabilidade online, a abertura é gratuita, condicionada à contratação do plano mensal.

A diferença se estende à mensalidade recorrente. Segundo a Pesquisa Limite, Estudo Contabilidade Online (2025), a mensalidade média na contabilidade online é de aproximadamente R$ 241, contra aproximadamente R$ 449 na contabilidade tradicional.

	Contabilidade online	Contabilidade tradicional
Honorários de abertura	R$ 0 na maioria dos casos	De R$ 500 a R$ 3.000
Mensalidade média	Aproximadamente R$ 241	Aproximadamente R$ 449
Atendimento	100% online, humanizado, por contadores reais	Presencial ou híbrido

Registro na Junta Comercial ou em cartório

Naturezas Jurídicas SLU e LTDA são registradas na Junta Comercial do estado, via REDESIM, a plataforma integrada do governo federal que centraliza o processo de abertura de empresas. Contabilidades online operam de maneira remota e integrada, o que tende a tornar o processo de registro mais rápido e menos burocrático. As etapas técnicas da REDESIM são traduzidas para plataformas próprias, permitindo que o médico envie documentos com facilidade e acompanhe o status da abertura em tempo real.

Empresas constituídas como sociedade simples, natureza jurídica voltada para profissões intelectuais e regulamentadas, são registradas no Cartório de Registro Civil de Pessoas Jurídicas, com emolumentos definidos por tabela estadual.

A taxa da Junta Comercial varia por estado: de aproximadamente R$ 135 no Paraná a aproximadamente R$ 650 no Rio de Janeiro. Em São Paulo, o valor para ME ou EPP constituída como LTDA ou SLU é de aproximadamente R$ 219 na JUCESP.

Inscrição da empresa no CRM

Toda empresa médica, independentemente da natureza jurídica ou do porte, precisa se inscrever no CRM do estado onde vai atuar. A taxa de inscrição de pessoa jurídica não é fixa, varia conforme o estado e é definida pelo Conselho Federal de Medicina daquela região. No Paraná, o valor é de aproximadamente R$950,00 reais, enquanto em SP o valor é em torno de R$1200,00  em 2026, 

Também são cobradas taxas de aproximadamente R$ 171 para emissão ou renovação de certificado e para alterações contratuais. O médico responsável técnico pela empresa precisa estar quite com o CRM pessoal para que o registro da PJ seja deferido.

Inscrição Municipal, Licença da vigilância sanitária e alvará de funcionamento

Toda empresa precisa se inscrever no município e emitir o Alvará de Funcionamento, com isso é gerado uma taxa anual chamada TFE (Taxa de Fiscalização de Estabelecimentos), o valor varia de estado para estado e de acordo com a atividade e quantidade de funcionários. Em SP, a TFE começa em aproximadamente R$236,00 reais enquanto no RJ esse valor sobre para R$1200,00 reais.

Além disso, pode exigir a vigilância sanitária, o seu grau de exigência depende do CNAE da empresa e da localidade. Consultórios restritos a consultas, enquadrados no CNAE 8630-5/03, são classificados como risco médio, o que normalmente dispensa a vistoria prévia para a licença inicial, com fiscalização realizada posteriormente. Atividades que envolvem procedimentos ou exames complementares, como os CNAEs 8630-5/01 e 8630-5/02, tendem a ter grau de risco maior e exigências adicionais.

As taxas variam por município e devem ser verificadas na prefeitura local. O registro no CNES, Cadastro Nacional de Estabelecimentos de Saúde, é etapa complementar obrigatória para empresas que prestam serviços de saúde.

Certificado digital

O e-CNPJ A1 é necessário para assinar documentos eletrônicos em nome da empresa, acessar sistemas da Receita Federal e emitir notas fiscais de serviço. Em 2026, o custo varia de aproximadamente R$ 149 a R$ 235. Algumas contabilidades online incluem o certificado digital no pacote de abertura, sem custo adicional.

Quanto custa manter um CNPJ médico depois da abertura?

O custo de ter um CNPJ médico não termina com a formalização da empresa. Depois da abertura, a empresa passa a ter obrigações anuais com o CRM, mensalidade contábil e impostos recorrentes. Entender esses custos antes de abrir é parte do planejamento, e uma contabilidade online especializada na área de saúde simula esse cenário completo desde o início.

Anuidade do CRM para pessoa jurídica

A anuidade do CRM varia em cada estado, ela é cobrada todos os anos e calculada com base no capital social declarado no contrato da empresa. A faixa de capital social definida na abertura determina quanto a empresa vai pagar ao conselho enquanto estiver ativa. Abaixo trouxemos os valores no Paraná:

Faixa	Capital social	Anuidade PJ 2026	Anuidade PJ 2027
1ª	Até R$ 50.000	R$ 948	R$ 989
2ª	Acima de R$ 50.000 até R$ 200.000	R$ 1.896	R$ 1.978
3ª	Acima de R$ 200.000 até R$ 500.000	R$ 2.844	R$ 2.967
4ª	Acima de R$ 500.000 até R$ 1 milhão	R$ 3.792	R$ 3.956
5ª	Acima de R$ 1 milhão até R$ 2 milhões	R$ 4.740	R$ 4.945
6ª	Acima de R$ 2 milhões até R$ 10 milhões	R$ 5.688	R$ 5.934
7ª	Acima de R$ 10 milhões	R$ 7.584	R$ 7.912

Empresas realizando a primeira inscrição, com no máximo dois sócios, sendo um médico, sem filiais, que realizem exclusivamente atividade médica sem exames complementares e não contratem serviços médicos de terceiros, têm direito a um desconto de 80% na anuidade, mediante requerimento ao CRM dentro do prazo estabelecido.

Para uma empresa na primeira faixa de capital social, isso reduz a anuidade de R$ 948 para aproximadamente R$ 190. As regras do requerimento devem ser verificadas no CRM regional antes da abertura.

Mensalidade da contabilidade

Com o CNPJ ativo, a empresa médica passa a ter obrigações mensais: apuração de impostos, emissão de guias, pró-labore do sócio e obrigações acessórias específicas da área de saúde, como a DMED, declaração anual de serviços médicos e de saúde exigida pela Receita Federal. Todas essas obrigações são acompanhadas pela contabilidade.

A mensalidade varia conforme o modelo contratado. Na média geral, os valores são de aproximadamente R$ 241 na contabilidade online e de R$ 449 na tradicional.

Com o CNPJ regularizado, o médico abre uma conta bancária PJ para receber de hospitais, clínicas e convênios separadamente das finanças pessoais, e a contabilidade online passa a acompanhar a emissão das notas fiscais e as obrigações mensais de forma integrada.

Impostos no Simples Nacional e Fator R

A escolha do regime tributário é uma das decisões que mais impacta o custo mensal da empresa médica. No Simples Nacional, a atividade médica é tributada pelo Anexo V, com alíquota inicial de 15,5%, ou pelo Anexo III, com alíquota inicial de 6%, quando a folha de pagamento, incluindo o pró-labore do sócio, representa 28% ou mais do faturamento. Essa relação é o Fator R, e sua aplicação deve ser simulada antes do registro, porque a decisão sobre o valor do pró-labore afeta diretamente o enquadramento.

O Lucro Presumido ou Simples Nacional Híbrido é outra opção para empresas médicas, especialmente para faturamentos maiores e/ou com muitas despesas ou quando o Simples Nacional não é vantajoso. A simulação entre regimes é parte do trabalho prestado por uma contabilidade online antes da abertura.

Como a abertura do CNPJ médico funciona na prática?

A abertura de um CNPJ médico começa com a contratação de uma contabilidade online ou tradicional. O passo a passo segue uma sequência em que cada etapa depende da anterior, e os custos aparecem em momentos diferentes do processo. 

Confira abaixo a ordem das etapas e onde cada gasto ocorre:

1. Escolha da contabilidade

O primeiro passo ideal para abrir um CNPJ médico é contratar uma contabilidade online ou tradicional, que será responsável pelo processo de abertura. Contabilidades online especializadas na área de saúde cuidam do processo de ponta a ponta, definindo junto ao médico a natureza jurídica mais adequada, o capital social a declarar no contrato (que vai determinar a faixa da anuidade do CRM), o CNAE correto e o regime tributário, com simulações personalizadas para identificar a menor carga tributária possível dentro da lei. 

Essa etapa não gera custos públicos, mas evita custos futuros: uma escolha errada de CNAE pode elevar o grau de risco na vigilância sanitária; um capital social mal dimensionado pode aumentar a anuidade do CRM desnecessariamente.

2. Registro via REDESIM

Com as definições feitas, a contabilidade protocola os documentos, incluindo o ato constitutivo (SLU, LTDA ou sociedade simples) na Junta Comercial via REDESIM ou no Cartório de Registro Civil de Pessoas Jurídicas. 

É nessa etapa que incide a taxa de registro, de aproximadamente R$ 110 a R$ 420 conforme o estado. A contabilidade online opera diretamente na REDESIM e usa tecnologia para monitorar cada atualização em tempo real, o que torna o processo mais rápido e integrado e menos burocrático.

3. Escolha do Regime Tributário e Emissão do CNPJ

Após a aprovação do registro, é necessário selecionar o Regime tributário para a Receita Federal liberar o CNPJ. A contabilidade acompanha e confirma a liberação.

4. Licença da vigilância sanitária, alvará e CNES

A contabilidade orienta sobre os documentos exigidos, os prazos e as particularidades de cada município, que variam conforme o tipo de serviço prestado e o grau de risco da atividade. 

O registro no CNES, Cadastro Nacional de Estabelecimentos de Saúde, é etapa complementar obrigatória para empresas que prestam serviços de saúde e segue normas da Agência Nacional de Saúde Suplementar que diferem conforme a natureza dos serviços.

5. Inscrição da empresa no CRM

Com o CNPJ em mãos, a empresa precisa se inscrever no CRM do estado. A taxa de inscrição de pessoa jurídica é de aproximadamente R$1.200 em 2026, mas varia de estado para estado. O médico responsável técnico precisa estar em dia com o registro pessoal para que o pedido seja deferido.

6. Pós-abertura: Conta PJ, contabilidade mensal e emissão de notas 

Com o CNPJ regularizado, os primeiros passos são assinar um plano mensal de contabilidade, se já não foi feito junto com a abertura, e abrir uma conta bancária PJ para separar as finanças pessoais das empresariais e receber de hospitais, clínicas e convênios. Algumas contabilidades online oferecem conta PJ integrada à plataforma contábil, o que elimina o envio manual de extratos e favorece um cálculo de impostos mais preciso. Com os dados chegando diretamente à contabilidade, a distribuição de lucros com isenção de IR acontece sem margem para erro.

A contabilidade online também habilita o emissor de notas fiscais no município e acompanha as obrigações mensais da empresa, incluindo a entrega da DMED e o cumprimento das normas aplicáveis ao tipo de serviço prestado.

Como reduzir o custo de abrir CNPJ como médico?

A maior parte dos custos de abertura de um CNPJ médico é definida antes do CNPJ ser liberado. Por isso, o alinhamento do capital social, CNAE e Fator R ajudam a determinar quanto a empresa vai pagar de CRM e de impostos nos anos seguintes, e é essencial que essas variáveis sejam simuladas antes do registro. Uma contabilidade online com foco em saúde conduz esse planejamento desde o início, orienta sobre o registro no CRM e, em muitos planos, não cobra honorários de abertura.

A definição do capital social impacta diretamente a anuidade da pessoa jurídica no CRM, calculada sobre o valor declarado no contrato. Declarar um valor compatível com a operação real, e não inflacionado, reduz o custo anual com o conselho.

Outro fator importante é verificar se a empresa se enquadra no desconto de 80% na inscrição da pessoa jurídica no CRM. O benefício existe para empresas que cumprem os critérios definidos pelo conselho e precisa ser requerido dentro do prazo. 

Além disso, simular o Fator R antes da abertura também é essencial. Quando a folha de pagamento representa pelo menos 28% da receita bruta dos últimos doze meses, o médico PJ enquadrado no Simples Nacional tributa pelo Anexo III, com alíquota inicial de aproximadamente 6%. Sem essa simulação, a empresa pode ser enquadrada no Anexo V, com alíquota inicial de aproximadamente 15,5%. A diferença é relevante e pode ser evitada com planejamento prévio.

Por fim, a escolha do CNAE define o grau de risco da empresa na vigilância sanitária e, consequentemente, o tipo de licença exigida. Um CNAE com risco sanitário mais elevado pode gerar exigências adicionais e custos que não se aplicariam a uma classificação mais precisa da atividade.

Custo de abrir CNPJ médico e contabilidade online: o que considerar antes de abrir sua empresa

Abrir um CNPJ como médico envolve custos que outras profissões não enfrentam. A inscrição da pessoa jurídica no CRM, aproximadamente R$ 1.200, e a anuidade anual, calculada sobre o capital social declarado, são obrigações exclusivas da categoria. Como médico não pode ser MEI, a contabilidade é exigida desde o primeiro dia, e a escolha do modelo contábil impacta diretamente o custo total: muitos planos de contabilidade online oferecem abertura gratuita e mensalidades mais acessíveis do que a contabilidade tradicional.

O que define quanto a empresa vai pagar ao longo dos anos, porém, não são apenas as taxas de abertura. O capital social declarado no contrato determina a faixa da anuidade do CRM; o CNAE define o grau de risco sanitário e as licenças exigidas;  e o Fator R determina se os impostos no Simples Nacional irão partir de 6% ou de 15,5%. 

Essas três variáveis são definidas antes do protocolo na REDESIM e dificilmente são corrigidas depois sem custo. Contar com uma contabilidade online desde a abertura permite que essas decisões sejam tomadas a partir de simulações prévias e sob a orientação de contadores especializados na área da saúde.